Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdss1Q33DR2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms