Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

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Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gbp8Q2V6D6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gbp8Q2V6D6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gbp8Q2V6D6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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