Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms