Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms