Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Cntnap5cQ0V8T7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntnap5cQ0V8T7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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