Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neurl1bQ0MW30 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Neurl1bQ0MW30 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms