Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kndc1Q0KK55 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms