Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.6 ms