Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MestQ07646 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MestQ07646 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MestQ07646 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MestQ07646 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MestQ07646 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MestQ07646 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MestQ07646 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MestQ07646 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms