Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tie1Q06806 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms