Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrx2Q06348 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms