Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cab39Q06138 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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