Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPINDOCQ05AH6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms