Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a1Q05722 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms