Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top1Q04750 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top1Q04750 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms