Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms