Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddr1Q03146 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms