Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms