Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms