Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GscQ02591 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GscQ02591 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GscQ02591 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GscQ02591 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GscQ02591 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GscQ02591 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GscQ02591 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GscQ02591 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GscQ02591 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GscQ02591 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GscQ02591 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GscQ02591 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GscQ02591 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GscQ02591 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GscQ02591 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GscQ02591 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GscQ02591 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GscQ02591 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GscQ02591 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GscQ02591 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GscQ02591 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms