Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms