Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms