Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms