Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms