Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Grin2bQ01097 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Grin2bQ01097 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Grin2bQ01097 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Grin2bQ01097 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Grin2bQ01097 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2bQ01097 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms