Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms