Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IhhP97812 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IhhP97812 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IhhP97812 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IhhP97812 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IhhP97812 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IhhP97812 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IhhP97812 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IhhP97812 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
IhhP97812 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IhhP97812 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IhhP97812 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IhhP97812 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IhhP97812 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IhhP97812 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IhhP97812 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IhhP97812 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IhhP97812 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms