Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SirpaP97797 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SirpaP97797 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SirpaP97797 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SirpaP97797 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms