Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Cmklr1P97468 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Cmklr1P97468 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cmklr1P97468 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cmklr1P97468 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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