Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bop1P97452 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bop1P97452 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bop1P97452 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bop1P97452 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bop1P97452 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bop1P97452 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bop1P97452 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms