Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms