Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp1P70399 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms