Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms