Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sycp3P70281 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms