Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf6P70279 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf6P70279 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms