Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SbdsP70122 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms