Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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