Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms