Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms