Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rps29P62274 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Rps29P62274 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Rps29P62274 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Rps29P62274 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Rps29P62274 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Rps29P62274 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Rps29P62274 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Rps29P62274 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Rps29P62274 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms