Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Depdc5P61460 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Depdc5P61460 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Depdc5P61460 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Depdc5P61460 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Depdc5P61460 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Depdc5P61460 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Depdc5P61460 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Depdc5P61460 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Depdc5P61460 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Depdc5P61460 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Depdc5P61460 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Depdc5P61460 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Depdc5P61460 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms