Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 2,134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tdrd6P61407 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Tdrd6P61407 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tdrd6P61407 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tdrd6P61407 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tdrd6P61407 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tdrd6P61407 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tdrd6P61407 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms