Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abce1P61222 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms