Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snap25P60879 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snap25P60879 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snap25P60879 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms