Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms