Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtnsP57757 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtnsP57757 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms