Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lim2P56563 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lim2P56563 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lim2P56563 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms