Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms