Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms