Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms